Именно из-за ранения Андрею Емельяновичу пришлось оставить службу. Работал заместителем директора, затем директором Кияницкого сахарного комбината, прокурором Кривого Рога (1927-1928) и Харькова (1928-1929). Однако Андрей Ведмедер не чувствует призвания к юриспруденции, ибо с детства его влекла техника. Весной 1929 года он добровольно уходит с должности прокурора Харькова в связи с занятиями на курсах по подготовке к поступлению в Харьковский технологический институт (ХТИ). С 1 сентября 1929 года Андрей Емельянович становится студентом авиационной специальности механического факультета ХТИ, на базе которого в апреле 1930 года создается ряд новых харьковских вузов. Специальность по авиастроению механического факультета ХТИ легла в основу создания Харьковского авиационного института (ХАИ). С 1 сентября 1930 года А. Е. Ведмедер зачисляется студентом второго курса самолетостроительного факультета ХАИ по специальности инженер-конструктор по самолетостроению.
Андрей Емельянович избирается секретарем парторганизации института. Вместе с первым директором института Г. Е. Петровым (Горбенко) принимает участие в строительстве корпусов института, в планировании и создании его материально-технической базы. Скольких бессонных ночей и напряженных дней это ему стоило! Приходилось неоднократно обращаться по самым насущным вопросам строительства в правительство Украины и ЦК КП(б)У.
В декабре 1931 года первый директор ХАИ Г. Е. Петров переводится на работу в Совнархоз и – беспрецедентный факт! – директором института приказом по Всесоюзному объединению авиационной промышленности назначается студент третьего курса А. Е. Ведмедер.
О таких незаурядных людях с хорошей авантюрной жилкой, как Андрей Ведмедер, слагались легенды. В 16 лет он командовал полком, студентом-третьекурсником руководил институтом.
Талантливый организатор, имеющий большой опыт государственной и партийной работы, он сумел уделить достаточное внимание строительству, хозяйственным задачам, учебному процессу и научно-исследовательским разработкам. Его энергия и настойчивость поразительны. Полным ходом идет строительство главного (учебного) инженерно-лабораторного (самолетного) корпусов, общежития студентов в Померках, двух помещений. Активируется работа по проектированию, изготовлению чертежей самолетов ХАИ-1 и ХАИ-2 при активном участии студентов, принимается решение о строительстве на Харьковском авиационном заводе первого в Европе пассажирского самолета с убирающимися шасси ХАИ-1. В газете «За авиакадры» 23 февраля 1932 года А.Е. Ведмер рассказывает об упорстве студентов в выполнении реальных дипломных проектов самолетов ХАИ-1 и ХАИ-2, в овладении наукой проектировании новых самолетов, в повышении качества обучения и выделяет их как пионеров реального дипломного проектирования.
Обязанности директора института требовали напряженной работы в течении всего рабочего дня. Однако А.Е. Ведмер не оставлял учебу. Регулярно заниматься он не мог, приходилось выборочно посещать лекции и практические занятия. Вечером, в свободное время, вместе со студентами своей учебной группы он прорабатывал лекции прошедших занятий, что позволило директору успешно закончить третий курс.
Из воспоминаний однокурсника В.М. Канневского: «После того как студента нашей 301-й группы Андрея Ведмера назначили директором института, эту группу прозвали «директорской». А.Е. Ведмер со своей учебной группой встречался обычно вечерами при проработке учебного материала. О своей директорской работе он не высказывался». Однокурсник П.А.Шустер вспоминает: «После долгого затишья в строительстве нового здания ХАИ с самого начала 1932 г. началась активная работа по его возведению. Я полагал, что строительство было «коньком» Ведмера. Он много времени ему уделял. Мы часто видели на стройке нового директора, вникавшего во все строительные, технические и бытовые вопросы». Активное участие в строительстве принимали студенты. Это позволило в основном завершить строительство главного корпуса в 1933 году перевести учебный процесс в новое помещение. Проработав директором ХАИ шесть месяцев и 6 дней А.Е. Ведмедер внес неоценимый вклад в развитие и становление института.
В мае 1933 года Андрей Емельянович вместе со студентами своей группы уезжает на преддипломную практику в Центральный аэрогидродинамический институт (ЦАГИ) и по его личной просьбе его освобождают от обязанностей директора. В ЦАГИ А.Н. Туполев предложил ему работу. Дипломный проект Андрей Ведмер защищал в филиале Московского авиационного института при ЦАГИ ( июль 1939 года).
Наконец у него появилась возможность целиком посвятить себя научно-техническому творчеству. Жизнь этого выдающегося человека оборвалась трагически – он погиб при летных испытаний гидросамолета, так и не успев воплотить в жизнь свои лучшие замыслы. Впрочем, памятник он создал себе при жизни – это главный корпус ХАИ, в который вложена часть его прекрасной души и который хранит в себе неуемную энергию первых покорителей воздушного пространства.